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法人県民税は、法人税割と均等割をあわせたものです。法人税割は使途秘匿金がある場合などを除いて、赤字決算の場合には課税されません。
均等割は決算状況に関わらず課税されますので、赤字決算の場合でも申告納付をしていただく必要があります。