明治６年（1873）、明治政府のキリスト教禁教令廃止を契機に、プチジャン神父が計画、ド・ロ神父が設計し、明治８年（1875）に竣工した。
　神学校は大浦天主堂の境内地内にあり、北斜面の中段から上段にかけて立地する。
　建物は地下１階、地上３階建てで、柱・梁・桁などの構造材を真壁風に露出し、柱間にはコンニャクレンガ（薄手の煉瓦）を積み上げ、表面を漆喰塗りとした木骨煉瓦造である。切妻造、桟瓦葺とし、梁間を狭めた中央部（３階）の屋根を高く載せて、南北面に下屋として片流れの屋根を設ける。各階の境目に小庇を廻す。
　平面は矩形で、１・２階の正面（南）側にべランダを設け、地階は梁間のほぼ半分の北側にのみ設ける。地階は桁行方向（東西方向）を二分して食堂と応接間、１・２階は東西方向の中廊下で南北に振り分けられた大小の部屋、３階は広い１室としている。
　小屋組は和小屋とする。天井は１・２階の各室内を漆喰塗りの平天井、２階べランダ・中廊下・階段室廻りをペンキ塗りの菱組格子、３階を化粧屋根裏とする。
　木造を骨格として煉瓦壁を充填する方法であるが、ド・ロ神父は建築技術の造詣が深く、その設計監督した建物は極めて堅牢そのものでこの建物も100余年経過しているが、なおその用に耐えている。
（「長崎の教会群とキリスト教関連遺産」構成資産候補建造物調査報告書引用）


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