長崎県内の高校及び大学の在京同窓会は下記のとおりです。
| 長崎市 | 長崎東高 在京同窓会 |
| 長崎西高 在京同窓会 | |
| 長崎南高 関東同窓会 | |
| 長崎北高 同窓会東京支部 | |
| 長崎工業高校 関東支部同窓会 | |
| 長崎鶴洋高 同窓会 | |
| 長崎商高 同窓会支部 | |
| 東京海星会（海星学園在京同窓会） | |
| 長崎南山高 関東同窓会 | |
| 活水高 同窓会東京支部 | |
| 長崎女子商 同窓会関東支部 | |
| 瓊浦高 関東地区同窓会 | |
| 純心女子学園 | |
| 佐世保市 | |
| 佐世保北高 在京同窓会（東京北星会） | |
| 佐世保工高 同窓会関東支部 | |
| 佐世保商高 同窓会東京支部 | |
| 西海学園 東京同窓会 | |
| 島原市 | 関東島高会 |
| 関東 島商同窓会 | |
| 島原工高 同窓会関東支部 | |
| 国見高 関東同窓会 | |
| 南島原市 | 関東口加会 |
| 島原南関東同窓会 | |
| 諫早市 | 諫早高 東京不知火会 |
| 諫早農高 瑞穂同窓会東京支部 | |
| 諫早商高 同窓会関東支部 | |
| 大村市 | 大村高 東京同窓会 |
| 大村城南高 同窓会関東地区 | |
| 大村工高 同窓会東京支部 | |
| 平戸市 | 猶興館高 同窓会東京支部 |
| 平戸高 東京首都圏同窓会 | |
| 松浦市 | 松浦高 同窓会関東支部 |
| 五島市 | 五島高 東京石城会 |
| 壱岐市 | 壱岐高 東京同窓会 |
| 対馬市 | 東京対馬同窓会 |
| 西彼杵郡 | 青雲高 関東青雲会 |
| 長崎北陽台高 | |
| 東彼杵郡 | 川棚高 同窓会関東支部 |
| 北松浦郡 | 清峰高 東京同窓会 |
| 長崎大学経済学部 | 瓊林会 東京支部 |
| 長崎県立大学 | 鵬友会 関東支部 |
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